Profesor Jerzy Bauer związał się z Akademią Muzyczną w Łodzi w 1960 roku. W latach 1980-1998 był kierownikiem Katedry Kompozycji, Teorii Muzyki i Rytmiki, a w latach 2000-2006 kierownikiem Katedry Teorii Muzyki. Pełnił także funkcję Dziekana Wydziału Kompozycji, Teorii, Wychowania Muzycznego i Rytmiki 1990-1996.
W latach 1989-91 sprawował funkcję wiceprezesa Zarządu Głównego Związku Kompozytorów Polskich.
Jerzy Bauer był laureatem wielu nagród i wyróżnień na konkursach kompozytorskich. W jego dorobku znalazły się utwory na instrumenty solowe, muzyka kameralna, liryka wokalna, kompozycje na orkiestrę, a także muzyka chóralna i utwory dla młodych wykonawców.

Artysta w 1980 roku został odznaczony Krzyżem Kawalerskim Orderu Odrodzenia Polski, w roku 2005 – Krzyżem Oficerskim Orderu Odrodzenia Polski, a w 2006 – Srebrnym Medalem „Zasłużony kulturze – Gloria Artis”.
W jego dorobku znalazły się nagradzane na konkursach kompozycje na orkiestrę, utwory na instrumenty solowe, muzyka kameralna, w tym liryka wokalna, dzieła chóralne i utwory dla młodych wykonawców. Muzyka Profesora była wykonywana na festiwalach o zasięgu międzynarodowym i ogólnopolskim (m.in. na Warszawskiej Jesieni i Festiwalu Musica Polonica Nova we Wrocławiu) oraz
imprezach muzycznych w Łodzi.
Prawykonań jego utworów dokonywali wielokrotnie łódzcy artyści i wciąż mają tę muzykę w swoim repertuarze.